YÖK tarafından istifası kabul edilen Prof. Dr. Asyalı,gerekçe olarak şu bilgileri verdi: “Cumhurbaşkanı Abdullah Gül tarafından, 2010 yılının aralık aynından beri sürdürdüğüm Kayseri Abdullah Gül Üniversitesi Rektörlüğü görevinden istifa ettim. Türkiye Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Kurumu’nda (TÜBİTAK) üstleneceğim görev sebebiyle rektörlüğü bırakmak zorunda kaldım. Üniversitenin akademik kadrosundaki görevime devam edeceğim. Bu şekilde üniversiteye katkı sağlamayı sürdüreceğim” dedi.
Prof. Dr. Asyalı, istifa dilekçesini Cumhurbaşkanı Abdullah Gül’ün son Kayseri ziyareti Ultrabet sonrası YÖK’e gönderdiğini ve son toplantılarında kabul edildiği belirtti. Asyalı, şöyle devam etti: “İstifa dilekçemi 27 Haziran’da YÖK’e sunmuştum. Son toplantıda görüşülerek kabul edildi. Tarafıma da resmi olarak bildirildi. Görevde kaldığım süre zarfında büyük desteklerini gördüğüm Kayseri kamuoyu, il yöneticilerine, bilimsel ve akademlik çevrelere çok teşekkür ederim.”
Prof. Dr. Musa Hakan Asyalı’nın ayrılmasının ardından Rektör Vekili olarak Prof. Dr. İrfan Alan görev yapacak.
